Розыгрыш Кубка УЕФА по футзалу состоит из трех групповых этапов и финального турнира на четыре команды. Критерии, определяющие положение команд в случае равенства очков, указаны в пунктах 6.16 и 6.17 регламента турнира.

Предварительный раунд
В зависимости от числа участников создаются группы по четыре команды из числа представляющих страны с низким рейтингом. Эти мини-турниры проводятся в начале сезона на поле одного из участников. В группе каждая команда играет с каждой, а дальше проходят только обладатели первых мест.

Основной раунд
К победителям групп предварительного раунда присоединяются команды из ассоциаций с более высоким рейтингом, за исключением четырех клубов с наивысшими коэффициентами. Участники разбиваются на шесть квартетов и проводят мини-турниры на поле одной из команд. Обладатели двух первых мест проходят дальше.

Элитный раунд
Из основного раунда в элитный выходят 12 клубов, к которым на этой стадии добавляются четыре участника с самым высоким рейтингом. В четырех группах по четыре команды поздней осенью проводятся мини-турниры. Все победители квартетов попадают в финальную часть.

Финальная часть
Заключительная стадия розыгрыша проводится на выходных в конце апреля на поле одного из полуфиналистов. Сначала играются два полуфинала, через два дня - матч за третье место и финал. Если по окончании 40 минут основного времени в матче за третье место счет равный, победитель определяется сразу в серии пенальти. Во всех других играх до нее проводится 10 минут дополнительного времени.