Начало 90-х годов XX века всегда будет стоять особняком в истории армянского футбола. В 1991-м страна получила независимость, а 17 января 1992 года была основана Федерация футбола Армении (ФФА). В том же году ФФА стала членом ФИФА, а через год присоединилась и к УЕФА.

Ранее армянские футбольные организации подчинялись центральной советской власти, что, впрочем, не мешало горной республике блистать на национальном уровне, в особенности в 70-х годах. В 1973 году ереванский "Арарат" стал чемпионом Советского союза, в 1975-м завоевал Кубок СССР, а в 1971 и 1976 годах финишировал на втором месте в национальном первенстве. В кампании 1974/75 ереванцы добрались до четвертьфинала Кубка европейских чемпионов, где с общим счетом 1:2 уступили мюнхенской "Баварии".

Имена Левона Иштояна, Оганеса Заназаняна, Аркадия Андреасяна и Хорена Оганесяна навсегда останутся в истории армянского футбола. Заназанян и Андреасян в составе сборной СССР завоевали бронзовые медали на Олимпийских играх-1972 в Мюнхене, а Оганесян помог сборной СССР занять третье место на московской Олимпиаде восемь лет спустя и участвовал в финальной стадии ЧМ-1982 в Испании. Ранее, в 1966-м, на первенстве планеты играл другой армянский футболист - Эдуард Маргаров.

В 1992 году состоялся первый чемпионат Армении по футболу. В турнире, проходившем по системе "весна-осень", участвовало восемь клубов, каждый из которых провел с остальными соперниками по четыре матча. ФФА с 1992 года разыгрывает и Кубок Армении, а также проводит матч на Суперкубок Армении, чемпионат страны по футзалу и различные юношеские турниры.

Армянские клубы регулярно играют в еврокубках, начиная свой путь с квалификаций Лиги чемпионов УЕФА и Лиги Европы УЕФА. "Пюнику" и "Бананцу" уже удавалось пройти как минимум один отборочный раунд в Лиге чемпионов и Кубке УЕФА соответственно.

Сборная Армении впервые приняла участие в квалификации крупного международного турнира, сражаясь в отборочном цикле ЕВРО-96. Армяне начали борьбу в той кампании 7 сентября 1994 года, когда уступили в Бельгии хозяевам со счетом 0:2. Почти через год, 6 сентября 1995-го, сборная Армении отпраздновала первую победу в официальном матче, на выезде взяв верх над македонцами - 2:1. С тех пор национальная команда регулярно принимает участие в отборочных циклах чемпионатов мира и Европы.

Армения не без помощи УЕФА достигла значительного прогресса в развитии футбольного хозяйства. В 2007 году началось строительство тренировочной базы для сборной Армении, на которой также будут юношеская академия и жилой корпус. Ожидается, что этот комплекс будет сдан в эксплуатацию в сентябре 2010 года. Европейский футбольный союз также помог ФФА восстановить Республиканский стадион в Ереване, где был постелен новый газон. Армения всегда считалась футбольной страной, и ФФА мечтает наконец добиться международного признания на уровне клубов и сборной. Именно поэтому работа по развитию футбола в Армении не прекращается ни на секунду.