На парижском заседании 23 мая 2000 года Исполнительный комитет УЕФА утвердил предложение об организации клубного турнира европейского масштаба среди женщин. Восемь раз он проводился под вывеской Кубка УЕФА среди женщин, а с сезона 2009/10 стал известен как Лига чемпионов УЕФА среди женщин.

В сезоне 2001/02 жеребьевка прошла в Германии во время чемпионата Европы по женскому футболу. В первом розыгрыше приняли участие 33 клуба. После единственного квалификационного матча 32 сильнейших коллектива были поделены на восемь групп по четыре команды, которые состязались между собой с сентября по октябрь. В финале на "Вальдштадионе" 23 мая сошлись "Умео" и "Франкфурт", который отпраздновал победу со счетом 2:0.

В сезоне 2002/03 борьбу за престижный трофей начали уже 35 клубов. В полуфинале "Умео" вернул должок своим прошлогодним обидчицам. Одолев немок в Германии по пенальти со счетом 7:6 после двух ничьих с результатом 1:1, шведские футболистки вышли в финал. В решающем противостоянии "Умео" встретился с датской "Фортуной", которая в полуфинале с общим счетом 8:2 разгромила "Арсенал". Дома шведки взяли верх со счетом 4:1, а на выезде забили датчанкам три безответных гола.

В кампании 2003/04 борьбу за престижный трофей начали 40 клубов, что не помешало гегемонии скандинавских и немецких клубов. В полуфинале действующий обладатель трофея обыграл датский "Брондбю", гарантировав себе очередное свидание с "Франкфуртом" в финале. Немки же в полуфинале со счетом 4:1 одолели шведский "Мальме". В первом матче футболистки "Умео" забили соперницам, которые до этого ни разу не проигрывали в основное время, три гола. В ответной встрече лучшая команда Европы забила "Франкфурту" еще пять мячей, не пропустив в итоге ни разу.

В сезоне 2004/05 на старт вышли 43 команды. Кубок вернулся в Германию, но победу праздновал не "Франкфурт", а "Турбине" из Потсдама. В финале немецкие футболистки с общим счетом 5:1 переиграли шведский "Юргорден".

В кампании 2005/06 борьбу за Кубок УЕФА по женскому футболу вновь повели 43 клуба. В финале встретились "Турбине", оставившая не у дел "Юргорден", и "Франкфурт". Последний и завоевал почетный трофей, выиграв у "Турбине" в первом финальном поединке на выезде с результатом 4:0. Ответный поединок, прошедший в присутствии рекордной аудитории в 13200 болельщиков, также завершился победой "Франкфурта" - 3:2. В ответной финальной встрече у победительниц отличились Штеффи Джонс и Биргит Принц, которые забивали и в финале дебютного розыгрыша турнира с "Умео".

Формат не претерпел изменений в сезоне 2006/07. На стадии четвертьфиналов настало время сенсации - обе немецкие команды выбыли из борьбы. "Франкфурт" проиграл "Кольботну", а "Турбине" - "Брондбю". В 1/2 финала "Арсенал" оставил не у дел "Брондбю", а "Умео" доказал свое превосходство над "Кольботном" и в четвертый раз в истории вышел в финал. В первом поединке в Швеции "Арсенал" взял верх с минимальным счетом, а дома отстоял нулевую ничью. В итоге англичанки впервые завоевали Кубок УЕФА.

В сезоне 2007/08 участие в турнире приняли 45 клубов, а "Арсенал" сложил полномочия уже после четвертьфинального поединка с "Лионом". В итоге сразу две команды - "Лион" и "Бардолино" - впервые пробились в 1/2 финала турнира, однако несмотря на внушительную поддержку местных болельщиков уступили "Франкфурту" и "Умео" в споре за место в финале. Для немецкого и шведского клубов это была уже третья встреча в решающем поединке Кубка УЕФА. На 12-й секунде первого матча Марта открыла счет, но ответный гол Конни Полерс принес "Франкфурту" ценную ничью на выезде - 1:1. Неделю спустя на глазах 27640 зрителей все та же Полерс забила по голу в каждом из таймов и помогла хозяйкам взять верх на "Вальдштадионе" - 3:2. Итоговая победа со счетом 4:3 сделала немецкий клуб трехкратным обладателем престижного трофея.

Сезон 2008/09, когда турнир в последний раз проводился под вывеской Кубка УЕФА, ознаменовался прорывом двух дебютантов. Немецкий "Дуйсбург" выбил в 1/4 финала "Франкфурт", а в полуфинале одолел "Лион". Соперником по решающему двухматчевому поединку стала российская "Звезда-2005", также впервые принимавшая участие в еврокубке. В плей-офф футболистки из Перми переиграли "Брондбю" и "Умео", однако трофей остался в Германии. Разгромная победа в России (6:0) и ничья в ответном матче на своем поле (1:1) принесли "Дуйсбургу" золотые медали. За заключительным поединком на "MSV Арене" наблюдало 28112 зрителей, что стало новым рекордом турнира.

В первом розыгрыше Лиги чемпионов УЕФА среди женщин в сезоне 2009/10 участие приняли представительницы 53 национальных ассоциаций УЕФА, а от восьми сильнейших чемпионатов было делегировано по два клуба. В финале, который начал проводится в формате одного матча, сошлись "Лион" и "Турбине". Основное и дополнительное время в Хетафе завершилось без голов, а в серии пенальти сильнее оказались футболистки из Потсдама - 7:6.

В сезоне 2010/11 в финальной встрече на лондонской арене "Крейвен Коттедж" сошлись все те же "Турбине" и "Лион". На этот раз голы Венди Ренар и Лары Дикенманн принесли победу француженкам - 2:0.

Кампания 2011/12 вновь прошла под знаком "Лиона". В полуфинале француженки катком прошлись по "Турбине", а в финальном поединке на мюнхенском "Олимпиаштадион" со счетом 2:0 одолели "Франкфурт". Голами в присутствии 50 212 болельщиков отметились Эжени Ле Сомме и Камиль Абили.